Revisión sobre la interpretación de redes neuronales artificiales y sus aplicaciones a genómica

J. García Rodríguez, B. Sinova Fernández, C. E. Carleos Artime

Debido al gran crecimiento de la capacidad de computación, uno de los campos en auge es el del aprendizaje profundo. El sector biomédico no ha sido ajeno a esta revolución. En la actualidad se están comenzando a utilizar todo tipo de topologías de red neuronales como alternativa a las herramientas hasta ahora utilizadas. El objetivo del trabajo consiste en ver cómo se pueden implementar redes neuronales que nos permitan modelar datos genéticos y genómicos sustituyendo a los modelos tradicionales sin perder por ello información acerca del modelo. Con este fin se realizará una revisión del estado del arte de los métodos de interpretación de redes neuronales y de las herramientas que existen en la actualidad y se mostrará cómo se pueden adaptar estas técnicas para tratar este tipo de datos. La ventaja de este planteamiento es que tiene en cuenta la tipología y la estructura de los datos, frente a otras alternativas actuales que enfocan el problema desde una perspectiva más general.

Palabras clave: Redes neuronales genómica genética interpretabilidad

A. García Galindo, O. González Velasco, J. M. Sánchez Santos, J. De Las Rivas Sanz, E. Sánchez Luis

P. Pérez Fernández, A. García Nogales

C. E. Carleos Artime, N. Corral Blanco, S. Álvarez Morán, A. Shatla

P. Román Román, S. Román- Román, J. J. Serrano Pérez, F. Torres Ruiz

I. Morillo, L. Bermúdez, D. Karlis

R. Caballero Águila, A. Hermoso Carazo, J. Linares Pérez

R. Caballero Águila, D. A. Hermoso Carazo, D. J. Linares Pérez

M. J. García-Ligero Ramírez, M. A. Hermoso Carazo, J. Linares Pérez

R. Caballero Águila, M. A. Hermoso Carazo, J. Linares Pérez

J. A. Cristóbal Cristóbal, P. Olave

A. Vaamonde Liste, M. Meijide Vecino, P. Muñoz Dueñas

A. Pérez-González, T. R. Cotos Yáñez, W. González–Manteiga, R. M. Crujeiras

A. V. García Luengo, I. Oña Casado

R. Mata Crespo

L. Davila Pena, B. Casas Méndez

T. R. Cotos Yáñez, M. A. Mosquera Rodríguez, A. Pérez González, B. Reguengo Lareo

A. García Nogales, P. Pérez Fernández

C. González Martín, A. Sedeño Noda

S. A. Mulema, A. Carrión García